卵巢囊肿是广义上的卵巢肿瘤的一种卵巢囊肿组织形态的复杂性超过任何器官，这是因为：①卵巢的组织结构具有潜在的富于发展的多能性;②卵巢在胚胎发生时期和泌尿系统非常接近，部分中肾组织可迷路进入卵巢;③卵巢来自胚胎生殖嵴男女同源，以后方分化。因而卵巢囊肿的发病原因很复杂超出正常病因的很多倍，下边我们把卵巢囊肿是怎样产生的以及它在临床上的分类做一个概括。
对卵巢囊肿是怎样产生的有以下七方面的说法：
1}子宫内膜种植学说：Sampson最早提出月经期脱落的子宫内膜碎片随经血逆流经输卵管进入腹腔，种植于卵巢和邻近的盆腔腹膜，并继发生长和蔓延发展成子宫内膜异位症。有生殖道畸形或梗阻的妇女常并发子宫内膜异位症，说明经血逆流可致子宫内膜种植重复的或过于粗暴的妇科双合诊，将子宫内膜挤入输卵管，引起腹腔种植输卵管通畅试验(通气、通液)及造影的操作规程不规范，将内膜碎片经输卵管压入腹腔引起腹腔种植腹壁刀口子宫内膜异位或分娩后会阴伤口出现子宫内膜异位症，是手术者将子宫内膜带至切口造成医源性种植。剖腹产及剖宫取胎术中宫腔内容溢入腹腔在缝合子宫切口时，缝线穿过子宫内膜层等引起的内膜种植。
2} 淋巴及静脉播散学说：在盆腔静脉或淋巴结中发现子宫内膜组织存在支持该论点并认为远离盆腔部位的器官如肺、手、大腿的皮肤和肌肉发生的子宫内膜异位可能是淋巴或静脉播散的结果
3} 体腔上皮化生学说：女性生殖系统上皮卵巢生殖上皮及盆腔腹膜胸膜均起源于体腔上皮，当受到炎症、创伤雌激素过高等因素的影响时，或体腔上皮，反复受经血激素或慢性炎症的刺激可以化生为子宫内膜样组织，形成子宫内膜异位症。80%的子宫内膜异位症发生在卵巢与卵巢生发上皮的化生潜能有关。但目前很多学者认为腹膜刺激合并子宫内膜异位症是果而不是因，而且腹膜刺激都发生在异位灶以外的部位
4} 免疫学说：有人认为在妇女免疫功能正常的情况下月经期经输卵管流入腹腔的内膜细胞为主的局部免疫系统所杀灭，若局部免疫功能不足或逆流腹腔内的内膜细胞数量过多时，免疫细胞不足以将杀灭即发生子宫内膜异位症。也有报道子宫内膜异位症患者有红斑狼疮或其它自身免疫疾病史者为无该病患者的两倍。从实验结果表明在子宫内膜异位症患者血清中lgG及抗子宫内膜自身抗体较对照组明显增加，其子宫内膜中的lgG及补体C3沉积率亦高于正常妇女，故认为子宫内膜异位症可能是一种自身免疫性疾病目前认为子宫内膜异位症患者既可有体液免疫，即B细胞应答反应增强，亦可有细胞免疫即T 细胞免疫功能不足。上述免疫功能的异常是内膜异位的原因，还是子宫内膜异位的结果仍有待确定。
