子宫内膜异位症的保守治疗有三种方法：手术，药物抑制和二者合并应用。治疗方式的选择一般取决于疼痛，不孕和病变的严重程度。当前，腹腔镜已成为所有微小病变，绝大多数轻症病变和多数中到重度病变的首选治疗方法，但大多数学者均认为相当一部分患者仍需要合并药物治疗。
外科治疗可恢复正常解剖关系，去除病灶并同时分离粘连，但手术也有不足之处，如术后的粘连可能导致不孕，严重的粘连使病灶不能彻底清除，显微镜下和深层的病灶无法看到，术后的并发症有时难以避免等。药物治疗虽有较好的疗效，但停药后短期内病变可能复发，致密的粘连妨碍药物到达病灶内而影响疗效。多年来，一直采用手术前后的药物治疗，理想的措施是在用药后的3～6个月无效时，行二次腹腔镜检以明确原因，及时治疗。术后的粘连是影响手术效果的主要原因，术前应用danazol或GnRa，在低雌激素的作用下，腹腔内充血减少，毛细血管充血和扩张均不明显，有利于手术的摘除。同时，腹腔液容量减少且清亮，其中纤维蛋白含量降低，使粘连易于分离，卵巢异位瘤易于剥离。腹腔内的上述改变，还可以预防术后粘连形成。
术后应用1～2个月的药物，可以抑制手术漏掉的病灶，预防手术后的复发。轻度子宫内膜异位症的病灶清除后，可以不用抑制性药物，因在手术后腹腔内环境改变，有利于生育力的恢复，多数手术后的妊娠发生于手术后的一年以内，在此期间可以考虑诱发排卵治疗，促进生育。如手术后6～12个月仍未妊娠，在找出不孕原因的同时，可给予抑制子宫内膜异位症的药物治疗。
